חברת ספנות הינה חברה אשר בבעלותה אוניות והיא מובילה מטענים או נוסעים באוניות החברה או באוניות מוחכרות.
חברות הספנות במאה ה- 21 בדרך כלל מתמחות בסוגים שונים של מטענים ומחזיקות אוניות מתאימות לסוגי המטען, כמו אוניות מכולות, אוניות למטען כללי, אוניות צובר, מכליות, אוניות נוסעים ועוד. חברה אחת יכולה להתמחות בהובלת מספר סוגי מטען.
לחברות ספנות גדולות קווי הפלגה, כלומר מסלולים קבועים ואוניותיהן פוקדות נמלים קבועים בדרכן.
בישראל פועלות מספר חברות ספנות ישראליות, כגון צים, מנו ספנות, גדות ועוד. כמו כן פועלות בארץ באמצעות נציגים ישירים
או סוכני אוניה מספר חברות ספנות גדולות מחו”ל כמו MSC ועוד.
חברות הספנות בארץ מאוגדות תחת לשכת הספנות הישראלית אשר הוקמה בשנת 1932. לשכת הספנות מייצגת את
גורמי הספנות בישראל, חברות בה כ- 56 חברות והיא פועלת לקידום הסחר הימי בישראל.